光盘文件系统的作用与我们所熟悉的FAT16、FAT32等硬盘文件系统的作用基本上是一样的，目前最常见的3种光盘文件系统是：
ISO-9660：由国际标准化组织于1985年颁布，是目前唯一通用的光盘文件系统，任何类型的计算机以及所有的刻录软件都提供对它的支持。因此，如果想让刻录好的光盘能被所有的CD-ROM驱动器都顺利读取的话，那就最好使用ISO-9660或与其兼容的文件系统；其他的文件系统只能在CD-R或CD-RW上读取，限制了光盘的通用性。ISO-9660目前有Level 1和Level 2两个标准。Level 1与DOS兼容，文件名采用传统的8.3格式，而且所有字符只能是26个大写英文字母、10个阿拉伯数字及下划线。Level 2则在Leve l的基础上加以改进，允许使用长文件名，但不支持DOS。
Joliet:微软公司自行定义的光盘文件系统，也是对ISO-9660文件系统的一种扩展，它支持Windows 9x/NT和DOS，在Windows 9x/NT下文件名可显示64个字符，可以使用中文。
Romeo:著名的Adaptec公司自行定义的文件系统，支持Windows 9x/NT，文件名最多可有128个字符，也支持中文，但不支持DOS。
